2018年22期

沙田柚生长素响应基因SAUR的鉴定及序列分析

作  者 陈玉梅,李璐璐,徐 媛,陈锦玲,李惠敏,秦新民
第一作者 陈玉梅
作者单位 广西师范大学生命科学学院,广西桂林
卷  号 46
发表年份 2018
发表刊期 22
发表页面 81-84
关  键  字 沙田柚;自交不亲和;SAUR基因;序列分析,, 沙田柚;自交不亲和;SAUR基因;序列分析,
摘  要 [目的]研究沙田柚生长素响应基因SAUR基因编码的蛋白质序列所包含的生物信息学。[方法]以沙田柚自交和异交花柱为材料,通过高通量测序技术进行转录组测序,在差异表达基因中鉴定出SAUR基因。[结果]该基因全长857 bp(登录号为MH281940),开放阅读框(ORF)为381 bp,编码126个氨基酸,编码的蛋白质理论等电点为5.76,相对分子质量为13.74 kD,含有1个与Auxin_inducible superfamily蛋白相同的保守结构域。沙田柚SAUR基因在自交1~3 d花柱中的表达量(RPKM)分别为8.42、56.02、53.45;而在异交1~3 d花柱中的表达量分别为11.98、36.74、8.53。氨基酸序列分析表明,该基因编码的氨基酸与克莱门柚和甜橙SAUR基因编码的氨基酸的同源性分别为100%、99%。系统进化树显示,沙田柚SAUR基因与克莱门柚和甜橙的亲缘关系很近,属同一进化分支。[结论]研究结果可为今后深入研究沙田柚自交不亲和机理提供参考。
附  件 沙田柚生长素响应基因SAUR的鉴定及序列分析
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