2017年36期

基于GBS技术的中华绒螯蟹的遗传特征分析

作  者 高祥刚,鲍相渤,高美玲
第一作者 高祥刚
作者单位 辽宁省海洋水产科学研究院,辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室,辽宁大连
卷  号 45
发表年份 2017
发表刊期 36
发表页面 80-82
关  键  字 中华绒螯蟹; GBS;SNP;遗传多样性;种群结构,
摘  要 [目的] 研究中华绒螯蟹经过多年的人工养殖、跨流域引种和增殖放流等活动可能会对其遗传特性造成的影响。[方法] 基于下一代GBS测序技术,利用SNP标记对辽河家系、辽河野生、长江群体、海南群体、黄河群体进行遗传特征分析。[结果] 经过条件为测序深度4×、Miss0.5、次要等位基因频率(MAF)>0.05 的过滤后,共获得 652 746个高质量的 SNP 位点用于群体的遗传分析,各群体平均观测杂合度(Ho)为0.084 4~0.124 9,平均期望杂合度(He)为0.097 4~0.200 3,群体平均π值(Pi)为0.158 3~0.254 4,群体Fi的平均测量值(Fis)为0.054 2~0.238 43。两两群体间遗传分化指数 Fst值结合系统发生树,可以看出,长江群体与海南群体的遗传距离较近,分化较小,表示海南的中华绒螯蟹苗种可能来自长江流域。[结论] 该研究揭示了不同水系中华绒螯蟹的遗传差异,探讨了其遗传多样性水平,为中华绒鳌蟹资源的合理开发利用与保护提供理论依据。
附  件 基于GBS技术的中华绒螯蟹的遗传特征分析
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